这些彩色玻璃花窗是世界上保存最完整、最典型的中世纪彩色玻璃杰作。围绕着圣经故事，这些花窗描绘出近五千个拜占庭风格的人物，它使整个大教堂成为“一座彩色玻璃博物馆”。
107,707块彩色玻璃拼成了一面巨大的玻璃幕墙，光线透过蓝色的玻璃，点亮了整个空间。这也是参考了古代基督教教堂的设计。
早期花窗玻璃多以圣经故事为内容，以光线配合图案的效果感动信徒。而一些教会所在地本地的传说和神话，也会进入其主题之中。近代以来，花窗玻璃彩色玻璃不仅出现在教堂，也在许多一般建筑、室内空间、产品中获得应用。
教堂的另外一个重点是彩色玻璃，在教堂内的彩色玻璃都非常特别，用玻璃制作图像台凸显出圣经里的人物或是故事，如为基督教徒会被这里的彩色玻璃所吸引，在教堂内部总共有56个玻璃窗，31个圆形的玫瑰图案以及25个彩色幅彩色玻璃窗的精美图案，但是在这56个玻璃窗只有4个是最完整无瑕的，其它的玻璃窗都是在1949-1951由当地主教的居民进行一些整修，而这些彩色玻璃窗都是由法国沙特尔省的LorinFirm所制造。
在这整栋的空间里，最大限度保留了彩绘玻璃出现的频率，极简中的五彩斑斓，红橙蓝绿四种色调的方形玻璃拼凑出的隔板，出现在楼梯两侧，显现出现有木质结构的几何形状，和远处横亘在人字形衡量之间的玻璃交相呼应，时刻提醒游客或工作人员，它的过去曾是历史悠长的教堂。
彩色玻璃爱德华大厦逐渐取消了门廊和弯曲的阳光房走廊，并增加了侧廊窗户的面积，直到整个教堂采用了大规模的一排窗户。这些窗户又高又大，几乎承担了墙的功能。并利用阿拉伯国家的彩色玻璃工艺，创作出丰富多彩的宗教故事，起到了向文盲传播教义的作用，也有很高的艺术成就。彩色玻璃主要是红色和蓝色。蓝色象征天国，红色象征基督的宝血。窗棂的施工工艺非常精细复杂。细长的窗称为“柳窗”，圆的称为“玫瑰窗”。彩色玻璃在教堂内部营造出神秘而壮丽的景象，一改罗马式建筑因光线不足而沉闷沉闷的景象，表达了人们内心对天堂的向往。